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Text File  |  1996-02-27  |  2KB  |  37 lines
  1.        Document 0628
  2.  DOCN  M9630628
  3.  TI    Two strong 5' splice sites and competing, suboptimal 3' splice sites
  4.        involved in alternative splicing of human immunodeficiency virus type 1
  5.        RNA.
  6.  DT    9603
  7.  AU    O'Reilly MM; McNally MT; Beemon KL; Department of Biology, Johns Hopkins
  8.        University, Baltimore,; Maryland 21218, USA.
  9.  SO    Virology. 1995 Nov 10;213(2):373-85. Unique Identifier : AIDSLINE
  10.        MED/96074513
  11.  AB    The human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) genome contains 20 exons
  12.        that are alternatively spliced from 16 splice sites to generate more
  13.        than 40 different mRNAs, including incompletely spliced and unspliced
  14.        mRNAs. In contrast to avian retroviral RNA, which has a cis-acting
  15.        element in gag that negatively regulates splicing (NRS), HIV-1 RNA did
  16.        not have any NRS sequences in the gag or pol genes detectable by a
  17.        splicing inhibition assay. However, this assay demonstrated that the
  18.        HIV-1 first 5' splice site competed with a cellular 5' splice site,
  19.        suggesting that HIV-1 may have some strong splice sites. To extend this
  20.        observation, we used a splice site swapping strategy to determine the
  21.        efficiency of 14 HIV-1 splice sites in human beta globin chimeras tested
  22.        in transient transfection experiments. While the 1st HIV-1 5' splice
  23.        site used in all spliced transcripts and the 4th 5' splice site used in
  24.        most of the 2-kb transcripts were efficient, the other splice sites,
  25.        including all the 3' splice sites, were less efficient, ranging in use
  26.        from 25 to 60%. We propose that this range of splice site efficiencies
  27.        contributes to the regulation of alternative splicing of HIV-1 mRNAs.
  28.  DE    *Alternative Splicing  Base Sequence  Binding Sites  Cell Line,
  29.        Transformed  Exons  Genes, myc  Genetic Engineering  Genome, Viral
  30.        Globin/GENETICS  Human  HIV-1/*GENETICS  Molecular Sequence Data  RNA,
  31.        Messenger/*GENETICS/METABOLISM  RNA, Viral/*GENETICS/METABOLISM
  32.        Support, U.S. Gov't, P.H.S.  Transfection  JOURNAL ARTICLE
  33.  
  34.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  35.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  36.  
  37.